Некоторые результаты деятельности отдела молекулярной биологии ФГБУ «ВГНКИ» за I квартал текущего года
Специалистами отдела молекулярной биологии, входящего в состав отделения Биотехнологии ФГБУ «ВГНКИ», за I квартал 2018 года в рамках ветеринарного мониторинга и анализа рисков возникновения резистентности зоонозных бактерий к антимикробным средствам выполнены следующие работы:
- проведено массовое параллельное секвенирование музейного штамма S. enterica ATCC14028 и четырех изолятов Salmonella enterica, выделенных из различных источников (куриный фарш, шкура, кости, кормовая соя) и обладающих различной устойчивостью к антибиотикам;
- проведена de novo сборка последовательностей, генотипирование и поиск генетических факторов (хромосомных и приобретенных), обеспечивающих резистентность к антибиотикам, при помощи онлайн-ресурса ResFinder;
- выявлены контиги плазмид, несущих множественную устойчивость к различным группам антибиотиков.
Также в настоящее время ведется разработка оптимального биоинформатического протокола определения плазмидных фрагментов и поиск интегронов.
В рамках Государственной работы по лабораторным исследованиям диагностики и профилактики болезней животных, направленных на обеспечение охраны территории России от заноса из иностранных государств и распространения болезней животных, выполнено 112 исследований на наличие ДНК вируса алеутской болезни норок (этап электрофоретической детекции).
Помимо этого, с 22 марта 2018 г. было проведено 48 исследований для определения наследственных болезней, окрасов, групп крови и особенностей экстерьера животных молекулярно-генетическими методами.
