ФГБУ «ВГНКИ» имеет санитарно-эпидемиологические заключения, дающие право на проведение работ с возбудителями инфекционных заболеваний III–IV групп патогенности и выданные на каждое структурное подразделение. Санитарно-эпидемиологическое заключение является официальным подтверждением наличия в структурном подразделении санитарно-гигиенических условий, обеспечивающих соблюдение требований биологической безопасности, защиту населения и охрану окружающей среды. Санитарно-эпидемиологические заключения выдаются на основании Федерального закона от 30.03.1999 № 52-ФЗ «О санитарно-эпидемиологическом благополучии населения» , Положения о государственном санитарно-эпидемиологическом нормировании, утвержденного постановлением Правительства Российской Федерации от 24.07.2000 № 554, и санитарных правил «Порядок выдачи санитарно-эпидемиологического заключения о возможности проведения работ с возбудителями инфекционных заболеваний человека I–-IV групп патогенности (опасности), генно-инженерно-модифицированными микроорганизмами, ядами биологического происхождения и гельминтами» СП 1.2.1318-03.
