Соглашение № 075-15-2021-1053 от «29» сентября 2021 г.
Проект «Формирование сетевой биоресурсной коллекции референтных штаммов микроорганизмов для государственных нужд (контроля качества питательных сред, находящихся в обращении лекарственных средств для ветеринарного применения, с/х продукции, продуктов питания и состояния объектов культурного наследия на базе ФГБУ «ВГНКИ» (Всероссийская государственная коллекция штаммов микроорганизмов, используемых в ветеринарии и животноводстве – ВКШМ) и БРЦ ВКПМ НИЦ КИ – ГосНИИгенетика. Создание вакцин нового поколения против болезней животных на основе селекционированных производственных штаммов микроорганизмов».
Проект реализуется в рамках Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019-2027 гг. в соответствии с Соглашением № 075-15-2021- 1053 от «29» сентября 2021 г.
Соисполнители:
Цель проекта: создание сетевой коллекции хорошо охарактеризованных референтных штаммов микроорганизмов для контроля качества питательных сред, находящихся в обращении лекарственных средств для ветеринарного применения, продукции сельского хозяйства, продуктов ее переработки и создание вакцин для животных, оценки состояния объектов культурного наследия на базе ФГБУ «ВГНКИ» и БРЦ ВКПМ НИЦ КИ – ГосНИИгенетика и обеспечение стандартными референтными штаммами контрольных лабораторий и исследовательских организаций в целях обеспечения биобезопасности и технологической независимости.
Задачи:
- развитие нормативной базы, связанной с использованием референтных штаммов микроорганизмов для контрольных целей, и разработка нормативных документов контроля качества продукции с использованием референтных микроорганизмов;
- формирование, обеспечение сохранности и регулируемой доступности коллекционного фонда референтных штаммов, используемых для контроля качествапитательных сред, находящихся в обращении лекарственных средств для ветеринарного применения, сельскохозяйственной продукции и продуктов питания;
- изучение и формирование коллекционного фонда референтных штаммов, для контроля микроорганизмов, вызывающих разрушение объектов культурного наследия (книги и рукописи), и разработка контрольных методологий, основанных на их использовании;
- селекция новых референтных штаммов и разработка методик для контроля качества питательных сред, находящихся в обращении лекарственных средств для ветеринарного применения, сельскохозяйственной продукции и состояния объектов культурного наследия;
- стандартизация коллекционных референтных штаммов микроорганизмов с использованием современной методологии штаммовой и таксономической идентификации, а также полногеномного секвенирования;
- разработка методов контроля свойств референтных штаммов и качества распространяемых образцов;
- разработка методов подготовки, хранения и использования образцов референтных культур;
- развитие методологии изучения видового и штаммового состава микробных загрязнений;
- развитие материально-технической базы биоресурсной коллекции ВКШМ и БРЦ ВКПМ;
- совершенствование стандартов работ с коллекционным фондом ВКШМ и БРЦ ВКПМ, включая контроль состояния коллекционного фонда ВКШМ и БРЦ ВКПМ; проведение штаммовой и видовой таксономической идентификации микроорганизмов, обработку информации о коллекционных культурах и регулирование доступности коллекционного фонда;
- создание информационной базы данных референтных штаммов микроорганизмов для государственных нужд, а также информационной инфраструктуры для выполнения сервисных работ для заказчиков;
- развитие консультационных и учебных работ на базе ФГБУ «ВГНКИ» и БРЦ ВКПМ, связанных с изучением и использованием коллекционного фонда референтных штаммов.
Результаты этапа 1
В 2021 году начаты работы по формированию целевой коллекции референтных штаммов на основе использования коллекционного фонда БРЦ ВКПМ и ВКШМ, разработаны элементы методической базы для последующего решения основной задачи проекта – создание сетевой коллекции хорошо охарактеризованных референтных штаммов микроорганизмов.
1. Были подготовлены списки коллекционных штаммов ВКШМ и БРЦ ВКПМ, которые потенциально могут использоваться в качестве референтных в области ветеринарии, контроля качества сельскохозяйственной продукции, продуктов питания, включая контроль лекарственной устойчивость микробных возбудителей заболеваний животных; контроль фармацевтической продукции ветеринарного назначения; контроль микробной загрязненности окружающей среды, сельскохозяйственного сырья, пищевой продукции, кормов для животных и санитарной микрофлоры микробиома животных; контроль качества питательных сред, используемых для микробиологических работ.
Проведена проверка жизнеспособности, таксономической идентификации и контролируемых свойств штаммов.
2. В качестве элементов методической базы в БРЦ ВКПМ были подготовлены:
- методика таксономической идентификации микробных контаминантов фондов культурного наследия;
- техническое задание для формирования информационно-поисковой базы данных о референтных микроорганизмах;
- приведены в соответствие с рекомендациями ISO 20387:2018 нормативные документы БРЦ ВКПМ, используемые для работ с коллекционными референтными штаммами микроорганизмов, включая методики, стандартные операционные процедуры, инструкции методики (всего 22 внутренних нормативных документа БРЦ ВКПМ).
3. На базе РНБ создана коллекция микромицетов, выделенных c поверхности документов и из воздуха хранилищ обследуемых документов. Была проведена таксономическая идентификация выделенных штаммов; получены данные о видовом разнообразии двух экологических ниш: микробиоты документов и воздуха книгохранилищ; проведен анализ сходства штаммов микромицетов с помощью бинарных коэффициентов.
4. На базе ФГБУ «ВГНКИ» создана Лаборатория Молекулярно-генетических технологий, задачей которой является проведение исследований по идентификации, изучению свойств и генетических особенностей референтных штаммов микроорганизмов, используемых в методиках контроля качества питательных сред, лекарственных средств для ветеринарного применения, сельскохозяйственной и пищевой продукции, и штаммов, перспективных для использования в качестве референтных, а также производственных штаммов ВКШМ и эпизоотических штаммов возбудителей инфекционных болезней животных.
